Проекты и публикации

Форма и минеральная плотность костей коленных суставов в развитии остеоартрита

C 2018 года я работаю с биобанком Великобритании (UK Biobank) - это большая база данных, сбор которых начался в 2006 году и продолжается по сегодняшний день. 500 000 британцев из разных регионов страны добровольно прошли детальный опрос о состоянии их здоровья и сдали образцы крови на генетический анализ. Сейчас идет вторая волна сбора данных в рамках UK Biobank Imaging Study. 100 000 добровольцев должны пройти МРТ головного мозга, сердца, денситометрию всего скелета, тазобедренных и коленных суствов до 2023 года.

Известно, что форма наших костей во многом обусловлена генетикой. При этом определенные вариации формы костей могут привести к развитию остеоартрита в течение жизни. А минеральная плотность в разных участках коленного суставах может предсказать насколько быстро заболевание будет прогресировать. На данный момент, эффективного лечения остеоартрита не существует. Однако, если мы сможем определить пациентов в группе риска в молодом возрасте, возможно мы сможем предотвратить заболевание.

В настоящий момент я работаю в рамках большого проекта по разработке алгоритмов машинного обучения для изучения формы костей и минеральной плотности разных участков скелета (AUGMENT study). Я специализируюсь на изучении коленного сустава. На начальном этапе мы вручную обозначаем форму бедренной, большеберцовой, малоберцовой костей и надколенника, а также остеофиты на 2000 цифровых денситометрических снимков. Это будет наша начальная выборка, на которой будет учиться наш компьютерный алгоритм. Затем компьютерный алгоритм, сам обозначит форму костей и остеофитов на новых 5000 снимках, а мы его проверим, исправим неточности и оптимизируем алгоритм. Затем компьютерный алгоритм проанализирует оставшиеся 93 000 снимков. В долгосрочной перспективе - изучить какие именно вариации формы и минеральной плотности костей связаны с остеоартритом и риском операции по замене сустава в будущем, а также какие гены влияют на эти вариации формы. Исследование в прогрессе. 
Когортные исследования Остеоартрит UK Biobank Машинное обучение
Made on
Tilda